A finales de 2004, aproximadamente 1.580 empresas agrícolas (el 2 % del total de granjas) explotaban ecológicamente en Eslovenia una superficie de unas 22.790 ha (equivalentes al 4,7 % de la superficie de uso agrícola). De esa superficie, el 91 % eran prados, el 7 % terrenos de cultivo, el 1,5 % cultivo de frutales, el 0,4 % horticultura, y el 0,2 % viñedos. En el cultivo ecológico de frutales se producen manzanas, peras, ciruelas, melocotones y cerezas.
Después de la fundación de varias asociaciones regionales, en junio de 1999 se fundó la "Union of Slovenian Organic Farmers Associations" (USOFA). La promoción estatal de la agricultura ecológica ha crecido desde 1999, situándose en 2003 en 2,5 millones de euros.
Hasta ahora, la única cadena de supermercados que ofrece productos ecológicos, y fruta y verdura biológica, es "Mercator". Además, se ofertan productos bio en diez tiendas de alimentación ecológica, así como en los mercadillos de campesinos, informa Darko Kolbl en su informe para la asociación Ekoconnect, dedicada a la colaboración Este-Oeste en la agricultura ecológica.